ในทำนองเดียวกัน จีนแสดงความกระตือรือร้นในการพัฒนาลำน้ำแม่โขง-ล้านช้างเพื่อใช้ในการคมนาคม และขนส่ง จีนเป็นเจ้าภาพในการสำรวจแม่น้ำโขงร่วมกันหลายครั้ง โดยจีนเป็นผู้ออกค่าใช้จ่าย การสำรวจที่ใช้เวลายาวนานที่สุด (83 วัน) ในระหว่างเดือนมกราคมถึงเมษายน 1993 คณะสำรวจประกอบด้วย เจ้าหน้าที่-นักวิจัย-ผู้เชี่ยวชาญของจีน ลาว ไทย และพม่า รวม 66 คน (ดู Report on an Investigation of Waterway Transportation along the Upper Mekong River of China, Laos, Myanmar and Thailand," by Upper Mekong Associated Survey Team of China, Laos, Myanmar and Thailand, May 19, 1993) นายกรัฐมนตรี จู หรงจี ให้สัญญาต่อที่ประชุมสุดยอดอาเซียนที่บรูไน (5-7 พฤศจิกายน 2001) ว่า จีนจะช่วยออกเงิน 5 ล้านเหรียญสหรัฐฯ เพื่อปรับปรุงเส้นทางเดินเรือในลำน้ำล้านช้าง-แม่โขง
การใช้แม่น้ำโขงเป็นสื่อในการสร้างความร่วมมือกันระหว่างประเทศในอนุภูมิภาคฯ ยังเป็นของใหม่ และมีประวัติความเป็นมาไม่สู้จะราบรื่นนัก การจัดตั้งคณะกรรมการแม่น้ำโขง (Mekong Committee) ในปี 1957 เกิดขึ้นหลังจากประเทศต่าง ๆ ในอินโดจีนได้รับเอกราชไม่นาน ผู้ส่งเสริมการจัดตั้งองค์กรนี้ที่สำคัญเป็นคนนอกภูมิภาค โดยมีกลไกของสหประชาชาติที่ตั้งอยู่ในกรุงเทพฯ คือ Economic Commission for Asia and the Far East หรือ ECAFE (ESCAP ปัจจุบัน) เป็นผู้อุปถัมภ์ที่สำคัญ ครั้งนั้นไม่มีจีนและพม่าร่วมด้วยเพราะปัญหาการเมือง
สงครามและความแตกแยกในกัมพูชาในช่วงปี 1978-1994 ทำให้สมาชิกของคณะกรรมการแม่โขงเหลือเพียง 3 ประเทศ จึงเรียกกันว่า Interim Mekong Committee ในช่วงนี้มีความขัดแย้งกันรุนแรงในบรรดาประเทศคอมมิวนิสต์ในอินโดจีนและจีน คณะกรรมการแม่น้ำโขงชั่วคราวจึงเกือบมิได้ทำอะไรเลย ในระหว่างนั้น รัฐบาลไทยซึ่งมีนายอานันท์ ปันยารชุนเป็นนายกรัฐมนตรีชั่วคราวสมัยที่ 1 (1991-1992) ได้พยายามจะปฏิรูปโครงสร้างของคณะกรรมการแม่โขงชั่วคราวใหม่ โดยเชิญจีนและพม่าเข้าร่วมด้วย รัฐบาลได้ดำเนินงานทางการทูต เพื่อชักชวนให้ทุกประเทศรวมทั้งจีนและพม่าเห็นชอบด้วย และมีนโยบายว่าถ้าไม่มีจีนและพม่า ก็ให้ระงับการรื้อฟื้นคณะกรรมการแม่โขงนี้เสีย แต่ยังไม่ทันสัมฤทธิผล รัฐบาลอานันท์ก็หมดวาระเสียก่อน รัฐบาลที่สืบทอดอำนาจต่อมา มิได้ยึดถือนโยบายนี้อีกต่อไป ภายใต้การนำของรัฐบาลชวน หลีกภัย ไทยได้เป็นเจ้าภาพจัดประชุมทำพิธีลงนามกันในข้อตกลงใหม่ที่เชียงราย เมื่อวันที่ 28 พฤศจิกายน 1994 (Agreement on the Cooperation for the Sustainable Development of the Mekong River Basin)